По правилам ТС регистрируются за физическим лицом по адресу, указанному в его гражданском паспорте или в свидетельстве о регистрации по месту фактического проживания, которое выдается органами регистрационного учета. Если у вас есть временная регистрации по месту действительного проживания в Уфе, то регистрация ТС производится по адресу, указанному в свидетельстве о регистрации по месту пребывания. Зарегистрировать такой автомобиль в Уфе можно на срок временной регистрации. Так регламентировано Приложением № 1 к приказу МВД России от 24.11.2008 года № 1001 «Правила регистрации автомототранспортных средств и прицепов к ним в Государственной инспекции безопасности дорожного движения МВД РФ.
Могу добавить еще, что согласно этого же Правила регистрации:
". Проведение регистрационных действий в отношении транспортных средств, принадлежащих физическим лицам, организовывается в пределах субъекта Российской Федерации в любом регистрационном подразделении Госавтоинспекции. Поэтому вы можете поставить на учет в район не выезжая из Уфы. Правда," …если регистрационное отделение не имеет технической возможности для обмена данными в автоматическом режиме, то все запросы оно проводит по старой схеме: при помощи телефона, телеграфа и прочих средств связи. В таком случае срок рассмотрения заявления может быть довольно длительным, но опять же не более 30 суток.»